洪武九年(1376年)，为削弱丞相和行中书省权力，废行中书省，在全国设十三个承宣布政使司(浙江、江西、福建、北平、广西、四川、云南、山东、广东、河南、陕西、湖广、山西)，置左右布政使各一人，主管一省民政和财政;设提刑按察使司管刑法;都指挥使司管军队。三者合称三司，互不统属，分别归中央有关部门管辖。在一些边远地区和少数民族地区，则单设都指挥使司等机构，实行军政和民政合一的统治。